Xung quanh toà lâu đài trắng tinh là một đống đổ nát và những tiếng nổ súng ầm ĩ bên tai . Một người phụ nữ đang ôm đứa con gái bé nhỏ của mình vào lòng . Đứa bé chỉ khoảng 3 tuổi , làn da cô bé đẹp của trắng như bông hoa hồng nhỏ , đôi mắt xanh lunh linh cả lòng người khi nhìn vào , đôi môi đỏ son . Một người hầu bước vào tâu rằng Đức vua có thể sẽ không trụ được lâu nên muốn nữ hoàng và công chúa đến tránh nạn ở khuôn gian khác một thời gian rồi trở lại .

Người hầu dẫn bà đến một cây cổ thụ rất to , là nguồn sức mạnh của thiên nhiên . Nhờ nó nên thiên nhiên ở đây đều xanh tốt đến thế nhưng bên trong nó chính là phi thuyền vượt không gian để giành cho lúc nguy cấp nhất khi vương quốc gặp nạn lớn . Chiếc phi thuyền biến mất trong chiều không gian vô hạn đó xuyên qua những không gian kỳ ảo .

Tại nước Nhật Bản , quận beika . Bây giờ là 6 giờ sáng , bình minh đang rạnh đông chờ đợi một buổi sáng tốt đẹp sắp đến những cơn gió lùa thổi những cây xanh xung quanh toà nhà beika to lớn khắp khu phố này . Rất nhiều cảnh sát đã đậu ở đó rất lâu rồi vì đã xảy ra liên tiếp hai vụ án trong một đêm , cả thiếu úy sato cũng bó tay vì thủ thuật rất tinh vi như vụ tự tử nênđành phải gọi cho shinichi dù sẽ biết hôm nay cậu rất bận rộn vì ngày khai mạc năm học mới . Sau cuộc điều tra kỹ mọi chi tiết trong vụ án , cậu đã có câu trả lời rằng kẻ giết hạ hai người kia chính là ông chủ makiro shiki cũng là thủ lĩnh của bang nhóm cướp ngân hàng hai tháng trước gồm ba tên và hai nạn nhân chính là người còn lại .

Mười lăm phút sau , ông ta đã được đưa đến đồn cảnh sát điều tra và kết tội . Shinichi lên chiếc xe ôtô  của chú shiratori và đưa kaito , aoko và shinichi đến trường trung học teitan . May thay vừa kịp thời vào học , trên sân khấu của trường đang biểu diễn thời trang và chia lớp . Shinichi đang đi tìm nước uống vì cổ họng cậu đã rất khát từ khi bắt đầu điều tra vì đường đi đến máy bán nước rất hẹp nên cậu đã đụng trúng một thiếu niên đang mang rất nhiều hồ sơ học viên nhập học .

"sao cậu không biết nhìn đường sao !! " shinichi cáu kỉnh nói

Tay cậu luôn sờ vào trán đang rất đau đớn . Thì ra đó là lớp tưởng hội học sinh của trường và ngoài ra cậu thường giám sát kết quả học tập của những học viên khác heiji haittori . Heiji tức tối đứng dậy thì gặp shinichi đang đứng đối diện , cậu liền nói muốn thách đấu với cậu nhưng shinichi từ chối ngay .

Giờ học bắt đầu , cô giáo chủ nhiệm của lớp là cô jodie là một người ngoại quốc . Đầu tiên , lớp tưởng đọc điểm danh cho lớp , shinichi nhìn ở bàn học dưới còn trống vì thiếu người . Bài học đầu tiên là nhật pháp và toán học . Buổi học trôi qua nhanh thật , đã đến giờ ra chơi kaito và aoko đã ăn ở căn tin của trường còn shinichi đang ngồi dưới gốc cây anh đào đang nở rộ khoe sắc cho mùa xuân thêm muôn sắc màu

Các học viên đang vui chơi một cách không có phiền muộn . Shinichi lim dim đôi mắt của mình , các bạn học nữ cứ vây quanh shinichi để xin chụp ảnh và chữ ký . Một cô gái xinh đẹp bước đến ngăn mọi người trật tự đó là kazuha hội tưởng ban kỷ luật , có nhiều tin đồn rằng cô đang yêu đơn phương heiji hội tưởng hội học sinh nổi tiếng là một thám tử miền tây vì cả hai là bạn thân từ khi học tiểu học dù khác lớp . Là cô gái hoàn hảo , rất giỏi akido và cũng là đại diện cho trường . Shinichi đến bắt chuyện làm quen với cô , bên ngoài nhìn cô như một sư tử Hà Đông như bên trong khá là dịu dàng .

Buổi học tiếp tục , lớp phó đang phát kết quả bài kiểm tra thử đầu học kỳ để thử xem thành tích đến nào nhưng không may shinichi chỉ được 80 điểm vì sai 2 câu hỏi về môn toán học . Đây là số điểm kém nhất cậu từng đạt vì từ tiểu học cậu đã được 100 điểm liên tiếp . Tan học , cậu thật sự rất buồn bã vì không biết nói sao với mẹ  , chắc bà buồn lắm . Cậu ngồi xuống góc cây anh đào mà cậu đã ngồi lúc sáng .

"hình như cậu đang gặp vấn đề! "

Một giọng nói vang lên khắp sân trường vắng lặng không một bóng người. Một tiếng đàn thật quyến rũ lòng người khi nghe và tiếng đàn du dương hoà vào cơn gió . Cậu nhìn lên cành cây to , một cô gái có mái tóc dài màu nâu pha chút của màu đen , cô mỉm cười với cậu . Bỗng trong sâu thẳm trong lòng vân lên một cảm xúc khó tả , cả bên má ửng hồng lên như trúng tiếng sét ái tình , một mối tình đầu của cậu .

" mình chưa thấy xinh đẹp đến thế . Bạn là... ?" Shinicho hỏi cô

Cô gái đẹp như nàng tiên giánh trần vậy . Cô gái im lặng , một cơn gió thổi những lá cây bay qua người cô và cô cùng gió biến mất . Shinichi trở về nhà nhưng trong lòng luôn nhớ cô gái đầy bí ẩn đó thì cuốn sách bài tập toán cậu rơi ra khỏi tay thì một cô gái khác nhặt nó .

" cuốn sách của cậu đúng không !? "

Cô gái trả cho shinichi . Một cô gái xinh đẹp và đầy sự cuốn hút . Giọng nói cô lạnh lùng đến từng chữ . Đó là shiho miyano học viên của trường đại học teitan , một ngôi trường lớn được thiết kế rất tiện lợi và tiện nghi rất hiện đại không thua kém gì trường trung học teitan , nó nằm ngay bên đường đối diện với trường trung học teitan . Shiho là cô gái chuyên nghiên cứu khoa học về những điều bí ẩn về thiên nhiên . Cô đã đạt ba chiếc huy chương vàng về môn khoa học , cô còn có một biệt danh là " tiểu thư sáng tạo " .

Shinichi bước về nhà với vẻ mặt như kẻ mất hồn . Yusaku và yukiko thật rất lo cho con trai mình đang bị gì . Cậu làm bài tập về nhà nhưng tấm lòng cậu luôn suy nghĩ rằng hai cô gái đó đúng là rất bí ẩn và kỳ lạ .